Бактерия Рюмина Констанина

Xanthobacter autotrophicus Py2, бактерия

 					
Имеющаяся информация о геноме собрана в двух записях базы данных RefSeq:
NC_009717.gbk - плазмида, кольцевая. Длина: 316164 bp.
NC_009720.gbk - хромосома, кольцевая. Длина: 5308934 bp.
Общая длина: 5625098 bp.
					
					
					

Окружение гена белка GlpD (индентификатор YP_001417705.1) бактерии Xanthobacter autotrophicus

 
Итак, соседи гена glpD - гены Xaut_2807 (раньше по цепи) и Xaut_2809 (дальше по цепи). Все они расположены на прямой цепи.
Расстояние до Xaut_2807 - 186 bp.
Расстояние до Xaut_2809 - 23 bp.
Относительная рамка считывания (рамка glpD полагается за ноль) Xaut_2807 - +0.
Относительная рамка считывания Xaut_2809 - +2.
Гены glpD и Xaut_2809 вполне могут быть в составе оперона, т.к. первый - glycerol-3-phosphate dehydrogenase,
а второй - glycerol kinase, т.е второй поставляет субстрат для первого.
Так оказалось, что и с 3', и с 5' конца гены на комплиментарной цепи лежат через 2 гена от glpD.
					

Сайт находится в стадии разработки